{"id":2922,"date":"2017-01-13T16:30:58","date_gmt":"2017-01-13T14:30:58","guid":{"rendered":"http:\/\/k1nytt.w.uib.no\/?p=2922"},"modified":"2017-01-13T16:30:58","modified_gmt":"2017-01-13T14:30:58","slug":"ukens-publikasjon-uke-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/2017\/01\/13\/ukens-publikasjon-uke-2\/","title":{"rendered":"Ukens publikasjon uke 2"},"content":{"rendered":"<p><strong>Ukens publikasjon er fra seksjon for nefrologi og urologi, hvor f\u00f8rsteamanuensis Christian Beisland er seksjonsleder.<\/strong><\/p>\n<p>Et av prosjektene ved denne seksjonen tar for seg nye vevsbaserte forskningsmetoder innen nyrekreft. PhD-kandidat \u00d8ystein Eikrem er f\u00f8rsteforfatter\u00a0p\u00e5 seksjonens utvalgte publikasjon:<\/p>\n<h3><a href=\"http:\/\/dx.doi.org\/10.1080\/21681805.2016.1238007\"><strong>Development and confirmation of potential gene classifiers of human clear cell renal cell carcinoma using next-generation RNA sequencing.<\/strong> <\/a><\/h3>\n<p align=\"LEFT\">Oystein S. Eikrem, Philipp Strauss, Christian Beisland, Andreas Scherer, LeaLandolt, Arnar Flatberg, Sabine Leh, Vidar Beisvag, Trude Skogstrand, Karin Hjelle, Anjana Shresta &amp; Hans-Peter Marti<\/p>\n<p>I dette arbeidet bekrefter gruppen at potensielle kliniske biomark\u00f8rer kan utvikles ved hjelp av formalin-fikserte paraffin-innst\u00f8pte vevsblokker i kombinasjon med next generation RNA sequencing teknologi. Det er n\u00e5 mulig \u00e5 unders\u00f8ke arkiv-materiale i retrospektive definerte pasientkohorter p\u00e5 et molekyl\u00e6rt niv\u00e5 som tidligere har v\u00e6rt sv\u00e6rt vanskelig \u00e5 oppn\u00e5. Gruppen har tidligere vist at man ved hjelp av ny teknologi kan gj\u00f8re heldekkende messenger RNA sekvensering p\u00e5 formalin-fikserte parafin-innst\u00f8pte vevsbiopsier med like resultater sammenlignet med fersk frosset vev (Eikrem et. Al, Plos One 2016). Gruppen har ogs\u00e5 vist at det er mulig \u00e5 kj\u00f8re RNA sekvensering fra sm\u00e5 mikrodissekerte bestanddeler fra formalin-fikserte parafin-innst\u00f8pte nyrebiopsier (Landolt et. al 2016). Gruppen gj\u00f8r for \u00f8yeblikket videre unders\u00f8kelser p\u00e5 protein-niv\u00e5 (LC-MS\/MS) og p\u00e5 miRNA ved hjelp av sekvensering p\u00e5 nyrekreftpr\u00f8ver. Hans-Peter Marti fikk tilslag p\u00e5 \u00e5pne prosjektmidler fra Helse Vest for prosjektet \u00abTargeting Epithelial-to-Mesenchymal Transition to treat advanced Renal Cell Carcinoma: From mice to men\u00bb hvilket vil styrke det p\u00e5g\u00e5ende arbeidet ytterligere.<\/p>\n<p>Bilde er hentet fra publikasjonen som finnes <a href=\"http:\/\/www.tandfonline.com\/doi\/full\/10.1080\/21681805.2016.1238007\">her.<\/a><\/p>\n<p align=\"LEFT\"><span style=\"font-size: xx-small\"><span style=\"color: #7368a1;font-family: AdvOTc20ddc96;font-size: xx-small\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-2932 alignleft\" src=\"http:\/\/k1nytt.w.uib.no\/files\/2017\/01\/isju_a_1238007_f0005_c-300x300.jpg\" alt=\"isju_a_1238007_f0005_c\" width=\"320\" height=\"320\" srcset=\"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/files\/2017\/01\/isju_a_1238007_f0005_c-300x300.jpg 300w, https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/files\/2017\/01\/isju_a_1238007_f0005_c-150x150.jpg 150w\" sizes=\"auto, (max-width: 320px) 100vw, 320px\" \/>Figure 5. <\/span><span style=\"font-family: AdvOT5fcf1b24\">Immunohistochemistry of carbonic anhydrase-9 (CA9) and tumor necrosis factor-<\/span><span style=\"font-family: AdvPSMP13\">a<\/span><span style=\"font-family: AdvOT5fcf1b24\">-induced protein-6 (TNFAIP6). CA9 (A: normal; B: tumor)and TNFAIP6 <\/span><\/span><span style=\"font-size: xx-small\"><span style=\"font-family: AdvOT5fcf1b24\">(C: normal; D: tumor) are overrepresented in human clear cell renal cell carcinoma tissue compared to adjacent <\/span>\u201c<span style=\"font-family: AdvOT5fcf1b24\">normal<\/span>\u201d <span style=\"font-family: AdvOT5fcf1b24\">renal tissue. Magnification 20, scale bar <\/span><\/span><span style=\"font-size: xx-small\"><span style=\"font-family: AdvOT5fcf1b24\">100 <\/span><span style=\"font-family: AdvPSMP13\">l<\/span><span style=\"font-family: AdvOT5fcf1b24;font-size: xx-small\">m.<\/span><\/span><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Ukens publikasjon er fra seksjon for nefrologi og urologi, hvor f\u00f8rsteamanuensis Christian Beisland er seksjonsleder. Et av prosjektene ved denne seksjonen tar for seg nye vevsbaserte forskningsmetoder innen nyrekreft. PhD-kandidat \u00d8ystein Eikrem er f\u00f8rsteforfatter\u00a0p\u00e5 seksjonens utvalgte publikasjon: Development and confirmation&hellip;<\/p>\n<p class=\"more-link-p\"><a class=\"more-link\" href=\"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/2017\/01\/13\/ukens-publikasjon-uke-2\/\">Read more &rarr;<\/a><\/p>","protected":false},"author":3633,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1219],"tags":[],"class_list":["post-2922","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-forskning"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2922","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/wp-json\/wp\/v2\/users\/3633"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2922"}],"version-history":[{"count":6,"href":"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2922\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2938,"href":"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2922\/revisions\/2938"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2922"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=2922"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/k1nytt.w.uib.no\/en\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=2922"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}