Ukens publikasjon er fra seksjon for nefrologi og urologi, hvor førsteamanuensis Christian Beisland er seksjonsleder.
Et av prosjektene ved denne seksjonen tar for seg nye vevsbaserte forskningsmetoder innen nyrekreft. PhD-kandidat Øystein Eikrem er førsteforfatter på seksjonens utvalgte publikasjon:
Development and confirmation of potential gene classifiers of human clear cell renal cell carcinoma using next-generation RNA sequencing.
Oystein S. Eikrem, Philipp Strauss, Christian Beisland, Andreas Scherer, LeaLandolt, Arnar Flatberg, Sabine Leh, Vidar Beisvag, Trude Skogstrand, Karin Hjelle, Anjana Shresta & Hans-Peter Marti
I dette arbeidet bekrefter gruppen at potensielle kliniske biomarkører kan utvikles ved hjelp av formalin-fikserte paraffin-innstøpte vevsblokker i kombinasjon med next generation RNA sequencing teknologi. Det er nå mulig å undersøke arkiv-materiale i retrospektive definerte pasientkohorter på et molekylært nivå som tidligere har vært svært vanskelig å oppnå. Gruppen har tidligere vist at man ved hjelp av ny teknologi kan gjøre heldekkende messenger RNA sekvensering på formalin-fikserte parafin-innstøpte vevsbiopsier med like resultater sammenlignet med fersk frosset vev (Eikrem et. Al, Plos One 2016). Gruppen har også vist at det er mulig å kjøre RNA sekvensering fra små mikrodissekerte bestanddeler fra formalin-fikserte parafin-innstøpte nyrebiopsier (Landolt et. al 2016). Gruppen gjør for øyeblikket videre undersøkelser på protein-nivå (LC-MS/MS) og på miRNA ved hjelp av sekvensering på nyrekreftprøver. Hans-Peter Marti fikk tilslag på åpne prosjektmidler fra Helse Vest for prosjektet «Targeting Epithelial-to-Mesenchymal Transition to treat advanced Renal Cell Carcinoma: From mice to men» hvilket vil styrke det pågående arbeidet ytterligere.
Bilde er hentet fra publikasjonen som finnes her.
Figure 5. Immunohistochemistry of carbonic anhydrase-9 (CA9) and tumor necrosis factor-a-induced protein-6 (TNFAIP6). CA9 (A: normal; B: tumor)and TNFAIP6 (C: normal; D: tumor) are overrepresented in human clear cell renal cell carcinoma tissue compared to adjacent “normal” renal tissue. Magnification 20, scale bar 100 lm.