We are happy to invite you to the coming CCBIO course this fall: CCBIO905 – Methods in Cancer Biomarker Research, September 27-29, 2022, as a fully digital event in Zoom.
This course focuses on the full panel of standard and advanced methods with relevance for cancer biomarker research. The intention is to provide an understanding of the various methodologies and their application in basic and translational cancer research. The course further covers relevant topics like optimal sample collection and biobanking.
The thematic parts include methods ranging from basic techniques on nucleotides and proteins to more advanced approaches, as well as bioinformatics and biobanking. The course will focus on methods to study biomarkers in tissue samples, blood samples, circulating tumor cells and DNA, and other biologic materials. Methodologies like PCR techniques, microarray, next-generation sequencing, bioinformatics and artificial intelligence, immunohistochemistry, in situ hybridization, protein ligation assays, Western blot and ELISA, tissue microdissection and proteomics, flow cytometry, flow and imaging mass cytometry, and biobanking will be presented. Changes in nucleic acids and proteins in different settings will be discussed, as will the clinical applications.
Who: The course is open to researchers, postdocs, PhD students, master students, students enrolled in the Medical Student Research Program, and national and international students and researchers interested in the topic.
Place: Online on Zoom. Access links will be sent to the registered participants in due time.
When: September 27-29, 2022
Deadline/registration: September 1 for non-UiB students (reg. throughSøknadsweb), and September 1 for UiB students (reg. through Studentweb) as well as for registration for non-ECTS participation.
Karrieredag for alle ph.d.-kandidater og postdoktorer ved Det medisinske fakultet – onsdag 19. oktober
Vi vil med dette informere om karrieredagen 2022 som vil bli holdt onsdag 19. oktober fra klokken 09.00 til 16.00 i auditorium 1, i BB-bygget. I tillegg til innlegg fra representanter fra UiB og eksterne aktører, vil uteksaminerte kandidater oppdatere oss på hva de har gjort etter fullført forskerutdanning. Dagen avsluttes med en rekke relevante workshops. Det serveres lunsj, og det vil være god tid til mingling mellom de ulike delene.
Detaljert program og informasjon om påmelding vil komme etter hvert, men hold gjerne av dagen!
Mvh
Ph.d.-koordinatorteamet
Career Day for all PhD candidates and postdocs at The Faculty of Medicine – Wednesday October 19th
Welcome to the career day for all PhD candidates at the Faculty of Medicine! It will take place on October 19th from 09.00 to 16.00 in auditorium 1, in the BB building at Haukeland. In addition to internal and external presenters, some of our earlier PhD candidates will update us on what they have done after graduating. Furthermore, there will be held several relevant workshops at the end of the day. Lunch will be served, and there will be good opportunities for mingling with your fellow candidates.
Detailed programme and information about registration will be sent later, but please save the date!
Avhandlingens tittel: «Glomerular and tubular proteome markers of progressive IgA nephropathy»
1. opponent: ph.d.Sigrid Lundberg, Danderys sjukhus, Sverige
2. opponent: ph.d. Dag Olav Dahle, Rikshospitalet
3. medlem av komiteen: professor Håkon Reikvam, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av professor Rune Bjørneklett.
Åpent for alle interesserte.
Maria Fagerbakke Strømme
Hovedveileder: professor Erik Johnsen Medveiledere: førsteamanauensis Rune Andreas Kroken og ph.d. Liv Solrunn Mellesdal
Prøveforelesning: Onsdag 8. juni 2022 kl. 10.15 Sted: Auditoriet ved Psykiatrisk klinikk, Sandviken sykehus, Sandviksleitet 1
Oppgitt emne: «Polyfarmasi ved behandling av schizofreni – evidens, fordeler og utfordringer»
Disputas: Onsdag 8. juni 2022 kl. 12.15 Sted: Auditoriet ved Psykiatrisk klinikk, Sandviken sykehus, Sandviksleitet 1
Avhandlingens tittel: «Use and non-use of antipsychotics and other psychotropic drugs in schizophrenia»
1. opponent: professor Elias Eriksson, Göteborgs universitet, Sverige
2. opponent: førsteamanuensis Katrine Kveli Fjukstad, Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet
3. medlem av komiteen: førsteamanuensis Stefan Hjørleifsson, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av professor emerita Brit Haver.
Åpent for alle interesserte.
Nina Elisabeth Hjorth
Hovedveileder: professor II Dagny Faksvåg Haugen Medveiledere: førsteamanauensis Margrethe Aase Schaufel og ph.d. Katrin Ruth Sigurdardottir
Prøveforelesning: Fredag 10. juni 2022 kl. 10.15 Sted: Auditorium 1, BB-Bygget, Jonas Lies vei 91
For å følge prøveforelesningen digitalt, se lenke i pressemeldingen
Oppgitt emne: «Forhåndssamtaler i Norge – hva skal til for nasjonal implementering, drift og monitorering?»
Disputas: Fredag 10. juni 2022 kl. 12.15 Sted: Auditorium 1, BB-Bygget, Jonas Lies vei 91
Avhandlingens tittel: «End-of-life care: Patients’ preferences and relatives’ experiences, with focus on communication and advance care planning»
1. opponent: professor Mette Asbjørn Neergaard, Aarhus Universitet, Danmark
2. opponent: ph.d. Christian von Plessen, Direction générale de la santé og Unisanté, Sveits
3. medlem av komiteen: førsteamanuensis Øyvind Thomassen, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av professor emerita Birgitta Åsjø.
Åpent for alle interesserte.
Anna Gjerde
Hovedveileder: professor Bjørn Egil Vikse Medveileder: professor Hans-Peter Marti
Avhandlingens tittel: «Low birth weight, intrauterine growth restriction and risk of chronic kidney disease in adult age»
1. opponent: professor Anna Bjerre, Universitetet i Oslo
2. opponent: professor Stein Hallan, NTNU
3. medlem av komiteen: professor Roald Flesland Havre, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av professor emeritus Arne Skarstein.
Åpent for alle interesserte.
Ridhima Das
Hovedveileder: professor Daniela Costea Medveiledere: professor Mihaela-Roxana Cimpan, professor Anne Christine Johannessen og forsker Salwa Suliman
Prøveforelesning: Torsdag 16. juni 2022 kl. 09.15 Sted: Olavsalen, Gamle hovedbygg, Jonas Lies vei 71
For å følge prøveforelesningen digitalt, se lenke i pressemeldingen
Oppgitt emne: «Tissue-engineered skin: Clinical applications and challenges»
Disputas: Torsdag 16. juni 2022 kl. 11.15 Sted: Olavsalen, Gamle hovedbygg, Jonas Lies vei 71
For å følge prøveforelesningen digitalt, se lenke i pressemeldingen
Avhandlingens tittel: «Novel Methods and Sources for Regeneration of Oral Mucosa»
1. opponent: professor Sally Dabelsteen, Københavns Universitet
2. opponent: professor Simon Whawell, University of Plymouth
3. medlem av komiteen: førsteamanuensis Stian Kreken Almeland, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av førsteamanuensis Rupavathana Mahesparan.
Åpent for alle interesserte.
Line Lindanger
Hovedveileder: førsteamanuensis Eivind Inderhaug Medveiledere: professor Eirik Solheim, professor emeritus Anders Mølster og overlege Torbjørn Strand
Avhandlingens tittel: «25-year results after anterior cruciate ligament reconstruction with the use of a patellar tendon autograft»
1. opponent: førsteamanuensis Magnus Forssblad, Karolinska institutet
2. opponent: professor ph.d. Kirsten Lundgreen, Lovisenberg sykehus
3. medlem av komiteen: professor Ove Furnes, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av professor emeritus Leiv Hove.
Fristen for å melde seg på årets NorDoc-konferanse er 13. mai.
Vi har gleden av å invitere våre ph.d.-kandidater til årets konferanse som finner sted i Bergen (Auditoriet Egget, Studentsenteret), 17.-18. juni.
Vi oppfordrer alle til å melde seg på konferansen, og det er her også mulighet for posterpresentasjon som vil gi 2 studiepoeng i formidlingsdelen av opplæringsdelen.
The registration deadline for this year’s NorDoc PhD Conference is May 13th.
We are happy to invite all our PhD candidates to this conference which will be held in Bergen (Auditorium Egget, the Student Centre), June 17th-18th.
We encourage everyone to register for the conference, which also gives you the opportunity of poster presentation which will give 2 credits in the dissemination part of the training component.
The web page for the conference can be found here.
Avhandlingens tittel: «Maternal pregnancy folate status and association to language impairment in children of women with epilepsy after prenatal antiseizure medication exposure»
1. opponent: ph.d. Rebecca Bromley, University of Manchester, Storbritannia
2. opponent: førsteamanuensis Arne Reimers, Lunds universitet, Sverige
3. medlem av komiteen: professor Maj-Brit Rocio Posserud, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av førsteamanuensis Mette Christophersen Tollånes.
Åpent for alle interesserte.
Igne Sinkeviciute
Hovedveileder: professor Erik Johnsen Medveiledere: professor Kenneth Hugdahl
Prøveforelesning: Mandag 9. mai 2022 kl. 10.15 Sted: Auditoriet ved Psykiatrisk klinikk, Sandviken sykehus, Sandviksleitet 1
For å følge prøveforelesningen digitalt, se lenke i pressemeldingen
Oppgitt emne: «Long term treatment with antipsychotics for patients with psychotic disorders. Describe the evidence and pros and cons for ongoing treatment with different antipsychotics beyond the first five years of illness»
Disputas: Mandag 9. mai 2022 kl. 12.15 Sted: Auditoriet ved Psykiatrisk klinikk, Sandviken sykehus, Sandviksleitet 1
Avhandlingens tittel: «Auditory hallucinations in schizophrenia and related psychoses: Effectiveness and response trajectories of atypical antipsychotic drugs»
1. opponent: professor Paola Dazzan, King’s College London, Storbritannia
2. opponent: professor II Jan Ivar Røssberg, Universitetet i Oslo
3. medlem av komiteen: professor Kjell Arne Johansson, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av professor Ole Bernt Fasmer.
We are pleased to invite you to the 2nd “We are pleased to invite you to the 2nd “How to write a successful research project application” workshop for PhD candidates. The workshop will motivate the PhD candidates to start early with his/her future research project through writing, training and gaining practical insights into the application process. We aim at offering participants more awareness of the external funding possibilities by working with a project proposal. The course will kick start the participants to quickly build a successful academic career in the nearest future.
Avhandlingens tittel: «Applying the Norwegian prescription database to study epidemiology and potential disease-modifying drugs in Parkinson´s disease»
1. opponent: professor K Ray Chaudhuri, King’s College, Storbritannia
2. opponent: dosent Karin Wirdefeld, Karolinska Institutet, Sverige
3. medlem av komiteen: professor Per Øyvind Enger, Universitetet i Bergen
Avhandlingens tittel: «Nutrients and contaminants in processed small indigenous fish species from Ghana – Implications for food and nutrition security»
1. opponent: dr.philos. Trond Brattelid, Høgskulen på Vestlandet
2. opponent: førsteamanuensis Monica Hauger Carlsen, Universitetet i Oslo
3. medlem av komiteen: ph.d. Catherine Schwinger, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av professor Jutta Dierkes.
Åpent for alle interesserte.
Ying Chen
Hovedveileder: professor Lars A. Akslen Medveiledere: førsteamanuensis Elisabeth Wik og ph.d. Tor Audun Klingen
Avhandlingens tittel: «The tumor microenvironment in breast cancer»
1. opponent: professor Tibor Tot, Uppsala universitet, Sverige
2. opponent: professor Elin Richardsen, Universitetet i Tromsø
3. medlem av komiteen: professor Kathrine Skarstein, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av førsteamanuensis Lars Helgeland.
Siste uke for disputas før sommeren er uke 25 (20.–24. juni). Innleveringen og forslag til komite må da være innlevert senest uke 14, da dato for disputas kan ikke være mindre enn ti uker etter innlevering. Vi gjør samtidig oppmerksom på at det er komiteen som avgjør datoen, og disputasen kan derfor finne sted senere, selv om man har levert innen fristen.
Frist for å levere avhandling og komiteforslag før sommeren: 22. juni 2022
Nuha Mohamed
Hovedveileder: professor Daniela Costea Medveiledere: professor Anne Christine Johannessen, ph.d. Elisabeth Sivy Nginamau og ph.d. Tarig Al-Hadi Osman
Prøveforelesning: Fredag 25. mars 2022 kl. 09.00 Sted: Auditorium 1, BB-bygget, Jonas Lies vei 91
For å følge prøveforelesningen digitalt, se lenke i pressemeldingen
Oppgitt emne: «The role of immune cells in the tumour microenvironment»
Disputas: Fredag 25. mars 2022 kl. 11.15 Sted: Auditorium 1, BB-bygget, Jonas Lies vei 91
Avhandlingens tittel: «Prognostic biomarkers and tumour immune microenvironment characterization in oral squamous cell carcinoma – A study on human samples from Sudan»
1. opponent: ph.d. Simon Whawell, University of Sheffield, Storbritannia
2. opponent: professor Bengt Hasseus, Göteborgs universitet, Sverige
3. medlem av komiteen: ph.d. Gudveig Cecilie Gjerde Gjengedal, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av professor Rebecca Jane Cox Brokstad.
Katinka Nordheim Alme
Hovedveileder: ph.d. Anne-Brita Knapskog Medveiledere: professor Torunn Askim, førsteamanuensis Mala Naik og professor Halvor Næss
Prøveforelesning: Tirsdag 1. mars 2022 kl. 10.15 Sted: Auditorium 1, BB-bygget, Jonas Lies vei 91
For å følge prøveforelesningen digitalt, se lenke i pressemeldingen
Oppgitt emne: «The anti-inflammatory effects of exercise«
Disputas: Tirsdag 1. mars 2022 kl. 12.15 Sted: Auditorium 1, BB-bygget, Jonas Lies vei 91
Avhandlingens tittel: «Sedentary behaviour and cerebrovascular disease: molecular mechanisms and the impact of bout duration. A multicentre cohort study»
1. opponent: ph.d. Niklas Joisten, Technical University Dortmund, Tyskland
2. opponent: professor Maria Hagströmer, Karolinska Institutet, Sverige
3. medlem av komiteen: professor Christian Alexander Vedeler, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av førsteamanuensis Leif Oltedal
Åpent for alle interesserte
Dag André Sangnes
Hovedveileder: førsteamanuensis Eirik Søfteland Medveiledere: ph.d. Georg Dimcevski og professor Odd Helge Gilja
Avhandlingens tittel: «Diabetic gastroenteropathy examined with wireless motility capsule»
1. opponent: førsteamanuensis Hans Törnblom, Göteborgs universitet, Sverige
2. opponent: ph.d. Kari Anne Sveen, Oslo universitetssykehus
3. medlem av komiteen: førsteamanuensis Kristin Moberg Aakre, Universitetet i Bergen
Disputasen blir ledet av professor emeritus August Bakke
Med økonomisk drahjelp fra Forskningsrådet vil det nå for første gang bli etablert en ernæringsrettet forskerskole for doktorgradsstipendiater ved UiB. Resarch school in Nutrition ved Senter for ernæring er én av to forskerskoler ved UiB som i denne runden har fått innvilget støtte.
Nasjonale forskerskoler er en ordning for å fornye og forbedre norsk forskerutdanning, og er et supplement til institusjonenes egne doktorgradsprogrammer. Til sammen er 192 millioner kroner bevilget til 12 forskerskoler ved ulike utdanningsinsitusjoner i Norge. Research school in Nutrition har fått totalt 16 millioner kroner som skal fordeles over en åtteårsperiode. Totalt kom det inn 33 søknader.
Vegard Lysne, klinisk ernæringsfysioloig og postdoc ved UiB og Haukeland universitetssjukehus, var primærsøker på søknaden sammen med professor Jutta Dierkes, som skal lede forskerskolen.
We are happy to be inviting you to three great courses at CCBIO for the spring term! Note the registration deadline February 1. The courses are primarily intended for PhD candidates and other students and young researchers, but are open to all. We aim for hybrid solutions, where those who want, can join in the auditorium (pandemic permitting), and the rest through online attendance.
Registration: If you are already enrolled at the University of Bergen (UiB), you register through Studentweb. If you are not enrolled at the UiB, but need the ECTS, you register through Søknadsweb, where you simultaneously apply for UiB guest student status (also deadline Feb. 1). If you don’t need the ECTS (credits/studiepoeng) and just want to be updated in the field, the courses have separate registration links for non-ECTS participation.
CCBIO906 Cancer Genomics, February 21-23, 2022
This 3 ECTS course will provide broad understanding of aspects of cancer genome biology and its investigation by next generation sequencing (NGS) technologies. Methods for analyzing DNA variation and structure and RNA expression patterns will be covered, as well as nuclear and chromatin structure. Also, ethical, legal aspects, and hereditary predisposition will be taught.
Learn:
What kinds of mutations may predispose for, contribute to, or appear during cancer development
How these variants can be detected by NGS methods and be analyzed bioinformatically
How to employ these methods to stratify patients both diagnostically and therapeutically
The different implications of the same aberrations depending on tissue type
Ethical and legal regulations regarding genetic analyses of patient samples
CCBIO904 Biomarkers and tumor biology in clinical practice, April 20-22, 2022
CCBIO904 is a 4 ECTS course covering tumor biological aspects important for the understanding of why cancer develops and which mechanisms are important for tumor growth, metastases and morbidity in patients. The course will focus especially on tumor biological changes that may have or already have significance for personalized cancer treatment and clinical trial studies of new diagnostics and treatment.
Get deeper insight into:
Tumor biological aspects of cancer.
Oncogenes, tumor-suppressor genes, gene re-arrangements, DNA repair, apoptosis and growth factors.
Different methods applied for «Gen-mapping». DNA analysis and sequencing.
Principals for cytokine therapy, gene therapy, rational «drug design,» monoclonal antibodies and protein engineering.
The interaction between tumor cells and microenvironment.
Relevant methods for specimen collection in the clinical setting for use of molecular techniques.
CCBIO908 Scientific Writing and Communication Seminar May 23-24, 2022
This 2 ECTS course is part of the CCBIO/INTPART program, where students’ education and exchange is promoted through collaboration between CCBIO and the Boston based Harvard Medical School and Harvard Kennedy School. Lecturers are Christine Møller, an experienced lecturer in medical and scientific writing with many years of experience as assistant editor of APMIS, Randy Watnick, assistant professor at the Vascular Biology Program, Harvard Medical School, and Media Advisor Marion Solheim who will be adding a lecture on science presentation.
Learn:
How to organize your ideas and improve your manuscript
How to use clear writing
How to organize your results and message
How to avoid common mistakes
How to present the problem statement
How to write titles and abstracts
How to use proper grammar, punctuation and numbers
